Особисте життя. Міллан став постійним жителем Сполучених Штатів у 2000 році та став громадянином США у 2009 році. Він живе в Лос-Анджелесі, Каліфорнія. У 1994 році він одружився з Ілюсіон Вілсон, з якою має двох синів.
У 2010 році його дружина Ілюсіон Вілсон вирішила розлучитися з Сезаром. Вони з Ілюсіон були разом з 1994 року – коли він дізнався, що вона планує, це призвело до спроби самогубства. Діти знайшли його та надали необхідну допомогу. Того ж року Сезар почав зустрічатися з Джагірою Дар, яка допомогла йому одужати.
Сезар Міллан заручений з Джахірою Дар: «Мій пакет готовий! Раха Льюїс – колишній співавтор PEOPLE. Вона пішла з PEOPLE у 2020 році.
Теорія Міллана про домінування у домашніх собак була описана як помилкова. Також у 2006 році Американська гуманітарна асоціація (AHA) вимагала від National Geographic Channel припинити трансляцію програми, заявивши, що Тактика навчання, показана на Dog Whisperer, була негуманною, застарілою та неналежною.
Сезар Міллан заручився з давньою дівчиною Джахірою Дар – IMDb. Сезар Міллан, зірка серіалу National Geographic «Собачник», зробив пропозицію своїй давній дівчині Джахірі Дар, актрисі та стилісту.
У 67 році нашої ери шлюб Цезаря з його другою дружиною Помпеєю, онукою колишнього диктатора Луція Корнелія Сулли, був коротким і супроводжувався скандалом. Після того, як Помпея була визнана перелюбною, Цезар розлучився з нею в 67 році нашої ери. У 41 рік Цезар одружився втретє на сімнадцятирічній Кальпурнії.