Посада віце-президента залишалася вакантною під час першого (425-денного часткового) терміну Джонсона, оскільки на той час не було можливості заповнити вакансію на посаді віце-президента.

По-перше, він домігся введення в дію заходів, яких наполягав президент Кеннеді під час своєї смерті – нового законопроекту про громадянські права та зниження податків. Далі він закликав націю «побудувати велике суспільство, місце, де сенс життя людини збігається з чудесами людської праці».

У 1862 році Лінкольн призначив його військовим губернатором штату Теннессі після того, як більша частина його була відвойована. У 1864 році Джонсон був логічним вибором на посаду напарника Лінкольна, який хотів послати повідомлення про національну єдність у своїй кампанії з переобрання, і став віце-президентом після переможних виборів у 1864 році.

«І я обіцяю вам, що ми не будемо зволікати, або ми не будемо вагатися, або ми не відвернемося, поки американці будь-якої раси, кольору шкіри та походження в цій країні не матимуть таке ж право, як і всі інші, брати участь у процесі демократії. »