Самодоповнення є ймовірність того, що праймер зв'яжеться сам із собою та з іншим праймером у парі. Низька оцінка власної 3'-комплементарності: виберіть праймери, які мають низьку оцінку власної 3'-комплементарності, як зазначено в детальному звіті про праймери NCBI Primer-BLAST. 2 січня 2019 р.

Береться місцеве самодоповнення передбачити тенденцію відпалу праймерів один до одного, не обов’язково спричиняючи самозасмоктування в ПЛР. Система оцінки дає 1,00 для комплементарних основ, -0,25 для збігу будь-якої основи (або N) з N, -1,00 для невідповідності та -2,00 для розриву.

Один ланцюг ДНК, який згортається назад на себе описується як самодоповнюючий.

Самокомплементарність коливається від 2 до 6, а самокомплементарність 3' від від 0 до 3 в різних парах праймерів.

Тепер клацніть отримати праймери, і згенерується діалогове вікно. Коли виявлено більше ніж одну можливу ціль. Оскільки ми хочемо націлити обидва варіанти цього гена, ми відзначаємо обидва прапорці.

Самодоповнення стосується того факту, що послідовність ДНК або РНК може згортатися сама по собі, утворюючи дволанцюгову структуру. Залежно від того, наскільки близько розташовані частини послідовності, які є самодоповнювальними, нитка може утворювати шпилькові петлі, з’єднання, опуклості або внутрішні петлі.