Антипаралельні засоби паралельні, але протилежно спрямовані. Два ланцюги ДНК антипаралельні, тобто вони йдуть паралельно, але в протилежних напрямках. Кожна молекула ДНК має два ланцюги нуклеотидів. Кожен ланцюг має цукрово-фосфатну основу, але орієнтація молекули цукру в двох ланцюгах протилежна.

Антипаралельне розташування в молекулах ДНК відноситься до: Один спіральний ланцюг, який проходить у напрямку 5' до 3', а інший ланцюг — у напрямку 3' до 5'.

Азотисті основи можуть утворюватися в пари лише певним чином: сполучення з Т і С, з’єднання з G. Це називається з’єднанням основ. Завдяки спаровуванню основ ланцюги ДНК комплементарні один одному, йдуть у протилежних напрямках і називаються антипаралельними ланцюгами..

У подвійній спіралі ДНК нитки йдуть у протилежних напрямках щоб дозволити створення пари між ними, який необхідний для реплікації або транскрипції закодованої інформації.

Числа 3′ і 5′ стосуються кількість атомів вуглецю в молекулі цукру дезоксирибози, з якою зв'язується фосфатна група. Вуглеці в цукрі пронумеровані за годинниковою стрілкою, починаючи з атома кисню. Ця асиметрія надає ланцюгу ДНК «напрямок», і основи в ДНК зчитуються від 5′ до 3′.

Структура ДНК складається з двох ланцюгів, кожна з яких складається з фосфатних і цукрових груп, що чергуються. Ці нитки з’єднані комплементарними азотистими основами, утворюючи структуру, подібну до сходів. Пасма антипаралельні, тобто вони біжать у протилежних напрямках, що має вирішальне значення для реплікації ДНК.