Кеннеді прийняв командування 80-футовим 40-тонним моторним торпедним катером Elco (MTB) у Тулагі на Соломонових островах. Його командування PT-109 тривало менше чотирьох місяців і закінчилося в ніч з 1 на 2 серпня, коли човен був розрізаний надвоє японським міноносцем «Амагірі» в протоці Блекетт— водний шлях, що з’єднує затоки Велла і Кула. 1 серпня 2023 р

Есмінець, пізніше ідентифікований як Амагірі, вдарив PT-109 прямо перед переднім торпедним апаратом правого борту, відірвавши правий борт корми човна. Удар підкинув Кеннеді навколо кабіни. Більшу частину екіпажу збило у воду.

Наприкінці Другої світової війни витрати на повернення PT човнів до Сполучених Штатів із-за кордону вважалися непомірно високими, тому більшість човнів були позбавлені корисних матеріалів і спалені.

Вибухає PT-109. Моряки Ендрю Джексон Кірксі та Гарольд Вільям Марні були вбиті миттєво, а двоє інших членів екіпажу були важко поранені та обгоріли, коли їх кинули в палаюче море, що оточувало човен.

Кеннеді (CV-67) буд знятий з експлуатації в Мейпорті, штат Флорида, 23 березня 2007 року. Корабель буде відбуксирований на недіючу суднову базу ВМС у Філадельфії, де його переведуть у режим збереження («консервований»).

82-річний Джеральд Зінсер, останній член екіпажу, який вижив, на борту приреченого PT 109 президента Джона Ф. Кеннеді в південній частині Тихого океану під час Другої світової війни, помер 21 серпня в Орандж-Парку, штат Флорида, від ускладнень хвороби Альцгеймера.