Коли гени розташовані поблизу в одній хромосомі, їхні алелі, як правило, успадковуються разом, якщо не відбувається рекомбінація. Це призводить до співвідношення потомства, яке порушує закон Менделя незалежного асортименту. Гени, розташовані далеко один від одного в одній хромосомі, ймовірно, будуть складатися незалежно.

Закон незалежного асортименту Менделя не поширюється на зв'язок. За законом успадковані гени вважаються незалежними один від одного. Оскільки два гени розташовані в одній хромосомі, зчеплення є винятком із цього правила. При цьому порушується самостійний асортимент шляхом зв'язку.

Коли гени розташовані близько один до одного в хромосомі, алелі в одній хромосомі частіше успадковуються як одиниця. Такі гени не виставляти самостійний асортимент і кажуть, що вони пов’язані.

За яких обставин два локуси можуть перебувати в одній хромосомі, але поводитися так, ніби вони незалежно розбираються при схрещуванні? Якщо два локуси генів знаходяться в негомологічних хромосомах, очікується, що гени в цих локусах сортуватимуть незалежно.

Коли гени знаходяться в одній хромосомі, але дуже далеко один від одного, вони сортуються незалежно через кросинговер (гомологічна рекомбінація). Це процес, який відбувається на самому початку мейозу, під час якого гомологічні хромосоми випадковим чином обмінюються відповідними фрагментами.

Хоча всі характеристики рослини гороху Менделя вели себе відповідно до закону незалежного сортименту, тепер ми знаємо, що деякі комбінації алелів не успадковуються незалежно одна від одної.