Ферменти екзонуклеази працюють шляхом розщеплення нуклеотидів окремо від кінця полінуклеотидного ланцюга. Ендонуклеази – це ферменти, які розщеплюють фосфодіефірний зв'язок всередині полінуклеотидного ланцюга.

Ендонуклеаза видаляє нуклеотиди всередині; екзонуклеаза видаляє нуклеотиди з кінців ланцюга.

Рестрикційні ферменти розщеплюють нуклеїнові кислоти шляхом розщеплення фосфодіефірного скелета, вивільняючи фрагмент. Пам’ятайте, що ендонуклеази та екзонуклеази відрізняються тим, де вони розрізають нуклеїнову кислоту! Ендонуклеаза розрізає Всередині ланцюга нуклеїнової кислоти, тоді як екзонуклеаза розрізає КІНЦІ.

Ендонуклеази розрізають ДНК або РНК посередині, тоді як екзонуклеази видаляють окремі нуклеотиди з кінців. У природі чужорідна ДНК потрапляє в бактеріальну клітину, швидше за все, через вірусну інфекцію, і природні захисні системи еволюціонували для боротьби з інфекцією.

Фермент рестрикції, також відомий як ендонуклеаза рестрикції, є бактеріальним захисним механізмом, який розрізає послідовності ДНК вторгнення патогенів у точних місцях для запобігання реплікації. Отримані послідовності фрагментів ДНК дають підказки щодо ідентичності ферменту рестрикції завдяки специфічності послідовності.

Визначення. Рестрикційні ендонуклеази – це ферменти, які розпізнають послідовності ДНК, сканують послідовність і розщеплюють фрагмент навколо або всередині цієї послідовності. Екзонуклеази — це ферменти, які розщеплюють полінуклеотидну послідовність або з 5'-кінця, або з 3'-кінця, по одному.