Дехто припускає, що Мона Ліза не є портретом однієї жінки, але майстерна суміш багатьох, ідеалізація всієї жіночості Леонардо. Інші припускають, що це міг бути один із молодих моделей Да Вінчі в драг.

Одна з теорій полягає в тому, що моделлю для портрета був давній учень і підозрюваний коханець Леонардо Джан Джакомо Капротті, також відомий на прізвисько Салаї. Інша теорія полягає в тому, що Мона Ліза – це автопортрет Леонардо як жінки. Жодна з цих теорій не сприймається більшістю істориків мистецтва.

“Мона Ліза — андрогін — наполовину чоловік і наполовину жінка," він сказав. Жіночий вплив, як він припускає, міг бути від Герардіні або, можливо, Беатріче Д'Есте, дружини міланського герцога Людовіко Сфорца, при дворі якого Леонардо працював наприкінці 15 століття.

Вчені та історики висунули численні можливості, включно з тим, що вона є Ліза дель Джокондо (уроджена Герардіні), дружина флорентійського купця Франческо ді Бартоломео дель Джокондо— звідси альтернативна назва твору «Джоконда». Цю ідентичність вперше запропонував у 1550 році біограф художника Джорджо Вазарі.

Традиційно вважається, що картина зображує італійську дворянку Лізу дель Джокондо. Вона написана олією на панелі з білої тополі. Леонардо так і не віддав картину родині Джокондо.

Деякі припускають, що Мона Ліза – це не портрет однієї жінки, але майстерна суміш багатьох, ідеалізація всієї жіночості Леонардо. Інші припускають, що це міг бути один із молодих моделей Да Вінчі в драг.