Яка різниця між QTL і GWAS? Дослідження загальногеномних асоціацій (GWAS) аналізують повний цікавий геном, щоб ідентифікувати локуси, пов’язані з фенотипом. Навпаки, аналіз QTL визначає, які молекулярні маркери пов’язані з фенотипом.

QTL покаже вам усі геномні регіони, які впливають на генотип. Загалом це дасть вам гени, пов’язані з ознакою, але не вкаже на конкретні геномні локуси, тобто SNP. GWAS — це коли ви хочете визначити конкретні локуси (SNP), які особливо підвищують ризик захворювання.

Однією з головних відмінностей є те, що: у відображенні QTL нам потрібно створити гібридизацію між двома батьками, іншими словами, первинні батьки для формування популяції мають бути у двох різних доменах, але у відображенні асоціації немає потреби, і ми можемо використовувати популяція сортів або ліній.

Гени поблизу GWAS збагачені ключовими функціональними анотаціями, перебувають під сильним вибірковим обмеженням і мають складні регуляторні ландшафти для різних типів тканин/клітин, тоді як гени поблизу eQTL позбавлені більшості функціональних анотацій, демонструють послаблені обмеження та мають простіші регуляторні ландшафти.

Аналіз QTL дозволяє дослідникам у таких різноманітних сферах, як сільське господарство, еволюція та медицина, пов’язувати певні складні фенотипи з певними ділянками хромосом. Метою цього процесу є щоб визначити дію, взаємодію, кількість і точне розташування цих регіонів.

Дослідження загальногеномної асоціації (GWAS). підхід до порівняння геномів багатьох різних людей, щоб знайти генетичні маркери, пов’язані з певним фенотипом або ризиком захворювання.